Науково-дослідні лабораторії природничо-географічного факультету є важливою складовою його наукової інфраструктури та осередками розвитку сучасних фундаментальних і прикладних досліджень. Їхня діяльність охоплює актуальні напрями біології, географії, екології, хімії та природокористування, поєднуючи виконання наукових досліджень із підготовкою висококваліфікованих фахівців і залученням здобувачів вищої освіти до наукової роботи.
У лабораторіях проводяться дослідження, спрямовані на вирішення актуальних проблем сучасної науки й суспільства: вивчення механізмів регуляції росту та розвитку рослин, дослідження ландшафтів і туристично-рекреаційного потенціалу регіонів, розроблення ефективних технологій очищення стічних вод та охорони довкілля. Результати наукової діяльності знаходять практичне застосування, впроваджуються у виробництво, висвітлюються у фахових наукових виданнях, презентуються на всеукраїнських і міжнародних конференціях, а також слугують основою для виконання наукових проєктів і створення об’єктів інтелектуальної власності.
На факультеті функціонують три науково-дослідні лабораторії:
1. Науково-дослідна лабораторія з вивчення екзогенної регуляції онтогенезу рослин (керівник – кандидат біологічних наук, доцент Поливаний Степан Володимирович);
2. Науково-дослідна лабораторія ландшафтознавства та краєзнавчо-туристичних досліджень (керівник – доктор географічних наук, професор Гудзевич Анатолій Васильович);
3. Науково-дослідна лабораторія досліджень адсорбційного очищення стічних вод (керівник – кандидат технічних наук, доцент Василінич Тамара Миколаївна).